Pintura Cromossômica, Oligopaints e TaT-Seq para Estudos Genômicos em Phyllostomidae e Passeriformes

A pintura cromossômica é uma técnica de comparação genômica ao nível citológico. As homologias encontradas por pintura cromossômica comparativa são úteis para estudos da evolução do cariótipo, mecanismos de rearranjos cromossômicos que ocorreram durante a evolução e determinação de relações filogenéticas. A metodologia Oligopaint envolve o mapeamento in silico de uma grande biblioteca de oligonucleotídeos para uma região cromossômica definida, permitindo visualizar rearranjos intracromossômicos, o que não ocorre com a pintura cromossômica. A abordagem unindo pintura cromossômica e Oligopaints é poderosa, contribuindo para uma compreensão clara dos rearranjos ocorridos. A definição destes rearranjos, por sua vez, é fundamental para a compreensão da biodiversidade, quanto à sua disposição em diferentes táxons e na reconstrução de filogenias. A montagem completa do genoma (TaT) é essencial para a compreensão da genética e da evolução de um organismo. Os dados de pintura cromossômica, oligopaints e sequenciamento estão totalmente integrados em uma abordagem única de mapeamento genômico. Estes dados também são úteis para a construção de filogenias, que poderão ser comparadas com filogenias moleculares tradicionais. Neste projeto continuaremos a utilizar as metodologias citogenômicas e introduziremos os oligopaints e sequenciamento TaT em morcegos da família Phyllostomidae e aves da ordem Passeriformes. Utilizaremos sondas de cromossomos totais de Phyllostomus hastatus e Carollia brevicauda, morcegos pertencentes a diferentes subfamílias de Phyllostomidae. Em aves serão usadas sondas de cromossomos totais de Burhinus oedicnemus. Para a construção de sondas de oligopaints utilizaremos a plataforma online PaintSHOP. O sequenciamento TaT será realizado em colaboração com a Shandong University of Technology, Zibo, China. Esses dados serão associados com filogenias moleculares construídas a partir da variação de sequência de 3 genes mitocondriais e 4 nucleares.