Pintura cromossômica, Oligopaints, sequenciamento TaT em Roedores e peixes Gymnotiformes

Preservar a biodiversidade implica em conhecer a quantidade de espécies, sua caracterização e sua história evolutiva. A análise genética tem se mostrado uma ferramenta excelente para a caracterização da biodiversidade, em associação com a análise morfológica, destacando-se as análises cariotípica e molecular. A Hibridização In Situ Fluorescente permite definir a localização física de um determinado segmento de DNA no cariótipo em estudo, sendo úteis para construir mapas comparativos de espécies. A pintura cromossômica é um instrumento útil e têm proporcionado informações essenciais para mapear homologias, reconstruir genomas ancestrais e estabelecer filogenias cromossômicas. Uma outra abordagem se refere ao mapeamento de sequências repetitivas. Estes estudos têm trazido contribuições ao entendimento de sua organização e evolução, especialmente em grupos onde a variação cromossômica é frequente, como roedores e peixes Gymnotiformes. Em 2013 produzimos sondas de Hylaeamys megacephalus e estamos mapeando os cariótipos de várias espécies de Sigmodontinae. Em 2017 meu orientado Willam Oliveira da Silva desenvolveu as primeiras sondas de cromossomos totais de Echimyidae (Caviomorpha) durante seu doutorado sanduiche na Universidade de Cambridge, UK. Ele produziu sondas de dua espécies de Proechimys e o artigo publicado em 2019 é o primeiro de mapeamento genômico comparativo em Echimyidae. Com essas sondas estamos detectando os rearranjos cromossômicos diversificam os cariótipos desta família. As sondas de Gymnotus carapo que obtivemos são únicas e estão permitindo fazer o mapeamento genômico de diversas espécies, com ênfase em Gymnotus. Neste projeto continuaremos a utilizar as metodologias citogenômicas e molecular e introduziremos os oligopaints e sequenciamento TaT. Para a construção de sondas de oligopaints utilizaremos a plataforma online PaintSHOP. O sequenciamento TaT será realizado em colaboração com a Shandong University of Technology, Zibo, China.