O USO DE LONG-READS EM ABORDAGENS GENÔMICAS E METAGENÔMICAS PARA VALORAÇÃO DA BIODIVERSIDADE AMAZÔNICA

Este projeto de pesquisa visa investigar a diversidade genética e o microbioma de organismos e ambientes amazônicos complexos, fazendo uso de tecnologias de sequenciamento de leituras longas. Serão investigadas as mudanças na comunidade microbiana durante a maturação do fruto do açaí, além de determinar a existência de um microbioma terroir para o açaí (Euterpe Oleracea), empregando sequenciamento de metagenomas completos (WMS) em amostras de solo e frutos de diferentes regiões. Será realizada também a análise genômica completa do açaizeiro, empregando uma abordagem híbrida de sequenciamento com long-reads e shortreads para obter o genoma completo da planta. Serão desenvolvidos pipelines de bioinformática para lidar com os desafios computacionais que surgirão ao longo do projeto. Com os resultados espera-se que esse estudo forneça montagens genômicas de alta qualidade do açaí, bem como uma compreensão aprofundada de seu microbioma e sua diversidade genética. Além disso, o uso de long-reads tem o potencial de contribuir para uma caracterização mais abrangente das comunidades microbianas na região. O projeto também aborda a necessidade e intenção de desenvolver abordagens bioinformáticas específicas para lidar com os dados de sequenciamento de long-reads e superar desafios que possam surgir durante o processo.