Vertebrados da Amazônia: mapeamento genômico e análise molecular em morcegos e aves

A pintura cromossômica estabeleceu uma maneira moderna de comparação genômica ao nível citológico. As homologias encontradas por pintura cromossômica comparativa são mapas simples, úteis para estudos da evolução do cariótipo, elucidação dos mecanismos de rearranjos cromossômicos que ocorreram durante a evolução e para a determinação de relações filogenéticas. Uma biblioteca genômica de BACs (Bacterial Artificial Chromosomes) consiste em muitos fragmentos de DNA que podem representar todo o genoma de um indivíduo. Cada BAC contém 100-200 kb de sequências genômicas contíguas, fornecendo sondas para hibridização in situ em cromossomos, possibilitando a ancoragem das sequencias no genoma e, portanto, realizar um mapeamento mais fino de sua organização. A abordagem unindo pintura cromossômica e BAC-FISH é poderosa, integrando informações das duas técnicas e contribuindo para uma compreensão clara dos rearranjos ocorridos. A definição destes rearranjos, por sua vez, é fundamental para a compreensão da biodiversidade, seja no que se refere à sua disposição em diferentes táxons, seja na reconstrução de sua filogenia. Neste projeto continuaremos a utilizar estas metodologias em morcegos da família Phyllostomidae e aves das ordens Passeriformes e Charadriiformes como primeira abordagem. A segunda abordagem deste projeto é associar os dados que temos gerado tradicionalmente em citogenética, com dados obtidos a partir de sequenciamento de DNA e montagem de filogenias baseadas nestes sequenciamentos. Essas técnicas, quando combinadas com abordagens clássicas baseadas em caracteres morfológicos e ecológicos, têm contribuído para a caracterização de táxons, assim como para o desenvolvimento de hipóteses de relacionamento evolutivo. Em meu Pós-Doutorado na Universidade de Cambridge, UK, desenvolvi sondas de cromossomos totais de Phyllostomus hastatus e Carollia brevicauda, espécies com grandes diferenças morfológicas e cromossômicas, pertencentes a diferentes subfamílias de Phyllostomidae. Estas sondas têm se mostrado muito úteis e eficientes como instrumento de caracterização citogenética. Assim, no presente projeto, pretendemos continuar a utilizar estas ferramentas para complementar nossos estudos anteriores em espécies da família Phyllostomidae e definir sua história evolutiva, testando o cariótipo ancestral que propusemos e fazendo uma filogenia que envolva toda a família. Para as demais famílias de quirópteros, usaremos sondas de Myotis myotis, um morcego da família Vespertilionidae. Em aves, para estudos de pintura cromossômica, serão usadas sondas de cromossomos totais de Burhinus oedicnemus. Também utilizaremos sondas de BACs construídas a partir de clones de Gallus gallus e Teaniopygia guttata. Esses dados serão associados com filogenias moleculares construídas a partir da variação de sequência dos genes COI, 12S rRNA e RAG 2.